Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms