Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms