Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CFAP73A6NFT4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms