Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL27Q9Y4X3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCL27Q9Y4X3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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