Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMG5Q9UPR3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms