Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms