Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms