Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFIP11Q9UBB9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms