Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSU72Q9NP77 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms