Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ELL3Q9HB65 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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