Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB1BQ9H0U4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB1BQ9H0U4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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