Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SLIRPQ9GZT3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
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