Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDGFDQ9GZP0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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