Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms