Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms