Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms