Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms