Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.2 ms