Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TIMM29Q9BSF4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TIMM29Q9BSF4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms