Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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