Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOXF2Q9BQY4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms