Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms