Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPR78Q96P69 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms