Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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