Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms