Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms