Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms