Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms