Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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