Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms