Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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USP43Q70EL4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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