Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms