Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms