Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms