Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A52Q3SY17 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms