Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms