Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms