Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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