Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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VPS72Q15906 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPS72Q15906 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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