Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF2Q15853 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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