Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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