Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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