Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms