Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms