Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms