Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIDRQ14159 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms