Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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