Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGRF1Q13972 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms