Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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