Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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APOFQ13790 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
APOFQ13790 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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